Молодой хакер по прозвищу Смеющийся Человек бросает вызов коррумпированной системе, оставляя загадочные следы в киберпространстве. Его действия, направленные против могущественных корпораций, скрывающих свои преступления, ставят в тупик спецподразделение по борьбе с кибертерроризмом. Майор Мотоко Кусанаги и её команда из Секции 9 берутся за это сложное дело, пытаясь выяснить мотивы и личность неуловимого преступника. Расследование погружает их в мир высоких технологий, где граница между человеком и машиной становится всё более размытой.