В 1868 году мир потрясли сообщения о гигантском подводном монстре, терроризирующем океан у берегов Сан-Франциско. Обеспокоенное правительство США отправляет экспедицию для поиска и уничтожения угрозы. Однако корабль экспедиции становится жертвой таинственного существа. В живых остаются лишь гарпунщик Нед Ленд, профессор Пьер Аронакс и его помощник Консель.

К их удивлению, их спасает не подводный монстр, а легендарная подводная лодка «Наутилус», построенная капитаном Немо, гениальным ученым и изобретателем. Немо оказывается борцом за мир, который потопил несколько военных кораблей, чтобы доказать бессмысленность морских войн.

Присоединившись к Немо на борту «Наутилуса», Аронакс, Ленд и Консель отправляются в эпическое путешествие по морским глубинам. Они встречают необыкновенных существ, исследуют таинственные подводные миры и сталкиваются с опасностями, о которых раньше не могли себе представить.