В секретной миссии объединяются вечные соперники Том и Джерри со шпионской командой Джонни Квеста, Хаджи и Бандитом.

Злодейский доктор Зин жаждет заполучить изобретение Бентона Квеста, способное решить мировые энергетические проблемы. Для этого он использует армию злобных кошек, чтобы похитить Бентона и охранника Рэйса Бэннона.

Джонни и его новоприобретенные пушистые союзники отправляются в рискованное путешествие, чтобы освободить его отца и предотвратить глобальную катастрофу. Их приключения приведут их к опасным локациям и поставят перед лицом грозных противников.

В этой захватывающей эскападе Тому и Джерри предстоит отложить свои распри в сторону, чтобы спасти мир и своих товарищей. От их слаженной работы зависит судьба как людей, так и животных.