Правительственный агент случайно раскрывает тайный заговор инопланетян, планирующих захватить Землю. Чтобы противостоять угрозе, он использует особую жидкость, созданную пришельцами для усиления своих солдат. В результате эксперимента агент обретает невероятные способности и становится Прототипом — единственным, кто может дать отпор инопланетному вторжению и спасти человечество.