Перед самым концом летних каникул Наоюки Асаба пробирается к школьному бассейну, где встречает загадочную Ирию Кана. Вскоре она переводится в его класс, но подружиться может только с ним. Её странное поведение и частые вызовы к директору настораживают, а на помощь ей неизменно приходит таинственный человек в плаще. Расследование школьного радиоклуба постепенно приоткрывает завесу над секретными военными разработками и инцидентами прошлого, в центре которых оказываются новейшие корабли «Манта» и пилоты для их управления.