В военно-морской тюрьме Йокосуки Симура, бывший член якудза, вновь переживает испытание насилием. Призванный во флот, он пообещал матери сдерживать свою агрессивную натуру. Однако бесчеловечное обращение со стороны других заключенных вынуждает его нарушить это обещание.

В борьбе за выживание Симура объединяется с другими заключенными, также страдающими от беспощадной системы. Вместе они бросают вызов чрезмерной власти надзирателей и добиваются справедливости в стенах тюрьмы.

На фоне динамичных сцен драк и саспенса, "Тюрьма военно-морского флота в Йокосуке" исследует темные уголки человеческой природы и подвергает сомнению границы нравственности в условиях экстремального давления.