В ходе поисков Спока космический корабль "Энтерпрайз" отправляется на карантинную планету Генезис. Экипаж ищет способ восстановить разум и тело их погибшего друга. Однако эта миссия становится более опасной, когда выясняется, что Спок живет в сознании доктора МакКоя.

Капитан Кирк, скорбящий по Споку, возглавляет рискованную операцию по спасению своих друзей. Но их задача усложняется, когда их корабль попадает в руки беспощадных клингонов, возглавляемых командиром Крюге.

Кирк сталкивается с бесконечными препятствиями, пытаясь спасти своих друзей и победить клингонов. В этом эпическом приключении на кону стоят не только жизни его товарищей, но и сам дух "Энтерпрайза".