В фантастической драме "Гадкие лебеди" раскрывается таинственная история города-призрака, в котором находится интернат для исключительных детей. Обучение юных гениев осуществляют загадочные существа "мокрецы", природа которых остается невыясненной.

Город охвачен странными климатическими изменениями, напоминающими библейский потоп. Привлеченные аномалией, различные комиссии и спецслужбы начинают расследование. Писатель Виктор Банев, отец одной из воспитанниц интерната, не остается в стороне и проводит собственное расследование.

В ходе него он оказывается втянут в противостояние за будущее человечества, и не только за судьбу своей дочери и других детей. Фильм призывает задуматься о выборе пути, который определит наш мир в будущем.