В загадочном мире, где границы между реальностью и миром духов размыты, старшая школьница Сакуракоджи Сакура становится свидетелем леденящего душу зрелища: юноша, позже представившийся как Огами Рей, сжигает людей при помощи сверхъестественных способностей.

Отважная Сакура не верит убедительным отрицаниям Рея и отправляется на поиски доказательств. Она убеждена, что Рей не тот, за кого себя выдает. Неутомимые поиски девушки приводят ее в тайное общество под названием "Code: Breaker", члены которого обладают экстраординарными силами.

Вместе с информатором Code: Breaker, Токио Мизухирой, Сакура погружается в опасный мир сверхъестественного и сталкивается лицом к лицу с темным прошлым Рея. Сможет ли Сакура раскрыть правду о загадочном новичке и остановить его разрушительную силу, прежде чем будет слишком поздно?