В современный криминальный водоворот крупного областного города попадает следователь Пафнутьев. Противостоя организованной преступной структуре и продажному руководству, он бросает вызов системе.

Чтобы победить в неравной борьбе, следователь использует нестандартные методы, опираясь на смекалку и хитрость. Пафнутьев отказывается следовать установленным правилам, рискуя карьерой и даже жизнью.

По мере продвижения расследования он раскрывает глубокую коррупцию и порочность, которая пустила корни на всех уровнях власти. В этой напряженной борьбе за правду Пафнутьев вынужден противостоять не только преступникам, но и собственному начальству.

Фильм "Гражданин начальник" - это захватывающая криминальная драма, исследующая хрупкий баланс между законностью и коррупцией, правдой и ложью в современном российском обществе.