В 2029 году люди получают возможность заменять конечности роботизированными частями, и Майор Мотоко Кусанаги руководит элитной группой 9-го отдела в службе безопасности. Они расследуют загадочного хакера по прозвищу Кукловод, чьи манёвры подрывают границы между человеком и машиной. Команда сталкивается с угрозами, которые уходят глубже обычной преступности, затрагивая политику, киберпространство и этику цивилизационного прогресса. По мере развития дела усиливаются сомнения и напряжение между членами группы: кому можно доверять, а кто может оказаться предателем, подталкивая к принятию рискованных решений ради общего блага. Расследование приводит к обнаружению узла международной конспирологии, в котором будущее на карте планеты висит на волоске. С каждым шагом геройские принципы и личные долги сталкиваются с суровой реальностью охоты за правдой. В ходе погони за Кукловодом открываются новые факты о том, как тесно переплетены судьбы людей и технологий. Конфликт усиливается, когда расследование приводит к критическим выборам, где цена победы может быть слишком высока. Финальные развязки обещают напряжённый конфликт между добром и опасной технологической эякуляцией, где каждый участник ставит на кон свою жизнь и достоинство.